• 课程安排

    讲解基于非靶代谢组学和脂质组学的分析思路和操作流程。

    课程分为3大部分,包括概念和文献解读,软件实操和多组学关联分析。其中多组学关联分析也适用于靶向代谢组学的分析。

    学习完课程后,可以合理设计代谢组和脂质组的实验方案,可以独立完成代谢组、脂质组的数据挖掘和图表绘制。

    数据分析基于Windows软件或者网页工具,统计学分析和画图基于R语言,零基础学员建议提前预习赠送的基础课程。课程中多组学部分关联分析基于WGCNA,有WGCNA分析基础后学习效果更佳。

    课前预习

    赠送课程

    1. R 语言基础

    2. 测序原理

    第一天

    代谢组学的发展历史和趋势

    1. 代谢组学与脂质组学的概念

    2. 代谢组学和脂质组学的主要研究手段

    3. 质谱的发展历史

    4. 不同质谱仪的参数及适用条件

    5. 代谢组和脂质组的应用

    6. 代谢组学的研究趋势

    第二天

    脂质组和代谢组相关数据库和文献的解读

    1. 质谱的原始文件格式

    2. 代谢组相关数据库

    3. 脂质组相关数据库

    4. 代谢组文献解读

    5. 脂质组文献解读

    第三天

    相关软件的安装

    1. Compound Discoverer 的安装

    2. Lipid Search 的安装

    3. MS-Dial 的安装

    4. Mzmine的安装

    5. MSconvert(PW)的安装

    第四天

    基于Windows系统的代谢组上游分析

    1. Compound Discoverer的介绍

    2. CD的非靶代谢搜库流程

    3. 手动给CD添加数据库

    4. 代谢组数据的“4张表”

    第五天

    基于Windows/Linux/MacOS系统的代谢组上游分析

    1. MS-Dial的介绍

    2. MS-Dial数据库的安装

    3. MS-Dial的搜库流程

    4. Mzmine的介绍

    5. Mzmine的搜库流程

    第六天

    基于在线工具和R语言的代谢组上游分析

    1. Met-DNA2的使用

    2. MetaboAnalyst LC-MS Processing的使用

    3. XCMS-online的使用

    第七天

    脂质组的上游分析

    1. Lipid Search 的搜库方法介绍

    2. Lipid Search 结果的查看与导出

    3. 用Compound Discoverer分析脂质组数据

    第八天

    基于在线工具和R语言的代谢组下游分析

    1. 基于网页进行统计学分析

    2. 基于MetaboAnalyst 进行富集分析

    3. 基于R语言进行代谢组下游分析

    第九天

    代谢组与其它组学的关联分析

    1. 代谢组与转录组的关联分析
    2. 代谢组与蛋白质组的关联分析

    3. 代谢组与微生物组的关联分析

    4. 代谢组与表型的关联分析

    第十天

    临床大队列的代谢组分析,数据共享和课程总结

    1. 运用蛋白质组和代谢组筛选新冠患者血清标志物

    2. 原始数据的上传

    3. 课程回顾和总结

    售后服务

    答疑

    1. 直播期间:微信群随时答疑
    2. 直播期间:课前半小时,腾讯会议答疑

    3. 课程结束后:每周一到周四,腾讯会议答疑

  • 讲师介绍

    资深生物信息工程师授课

    基因课介绍

    成立于 2017年7月,专注于生物信息学培训。

    主讲老师 黄老师

    2018年通过Thermo Q Excative生物分子应用培训。
    参与过多个物种的蛋白质组学,代谢组学和脂质组学的研究。擅长蛋白质组,代谢组和宏基因组的联合分析。
    专注于以质谱为基础的代谢组学以及整合多组学进行基因的功能研究。研究工作发表于Frontiers in Cell and Developmental Biology,Frontiers in Microbiology等SCI期刊。

  • 立即报名!

    全面、系统的学习生物信息

    本期课程

    仅学习本期课程

    ¥2900.00

    本期

    本期课程直播+视频回放

    腾讯会议答疑

    赠送:分析流程、教材

    服务器账号供练习

     

    超级会员

    可学习基因课线上线下全部课程

    ¥10900.00

    每年

    基因课课程全部开放

    会员专享免预约腾讯会议答疑

    包含:

    《基因组与比较基因组专题课程》

    《重测序与群体遗传专题课程》

    《转录组与表达挖掘专题课程》

    《ChIP-Seq 数据分析专题课程》

    《单细胞转录组分析专题课程》

    《生物信息平台搭建专题课程》

    《R语言与出版级绘图专题课程》

    《叶绿体、线粒体专题课程》

    《细菌真菌基因组专题培训班》

    《长非编码RNA与表达调控专题培训》

    《 蛋白质组学专题培训》

    《甲基化测序数据分析》

    《生物信息入门之 Linux》

    《生物信息入门之 R》

    《生物信息入门之 Python》等

    赠送:

    全套分析流程、教材

    服务器账号供练习

  • 常见问题

    1. 如何咨询?

    • 客服:15337132798(微信同号)
    • 张老师:18617043002(微信同号)

    2. 在哪里学习?

    • PC 端:www.genek.cn 点视频课;

    • 微信端:"基因课" 公众号点视频课;

    • 课程有效期内可以无限次回放。

    3. 我是零基础,能学会吗?

    跟以往课程不同,本次课程几乎全程在 Windows 下使用图形化软件完成,不需要 Linux 基础。

    相比线下培训,线上培训给了学员充足的时间练习,配合答疑,完全可以掌握。

    4. 电脑配置有什么要求?

    本期培训数据分析在个人电脑上完成,要求个人电脑运行流畅,内存8G以上,mac系统建议安装windows虚拟机。

    5. 如何报名?

    推荐直接线上购买,如需对公转账,请联系我们。

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    银行对公转账
    户名:武汉简并科技有限公司
    开户银行:汉口银行股份有限公司光谷分行
    账 号:005041000451905

    开户行行号:313521000982

    转账备注“单位-姓名”。

    6. 关于合同、发票、培训通知

    • 通知:可提供培训通知、会议通知
    • 发票:可开培训费、会议费、技术服务费等,其他请联系客服
    • 合同:可提供合同、清单等