• 课程简介

    互动直播 + 腾讯会议答疑 + 无限次回看

    学习方式

    • 在线直播
    • 每天 1.5 小时，连续 6天
    • 无限次回看视频
    • 通过微信群、腾讯会议终生答疑

    配套资料

    • 自编配套教材
    • 一整套分析代码和测试数据

  • 课程安排

    第一天

    硬件选购

    1. 硬件知识：服务器与个人电脑有什么区别？
    2. 硬件知识：CPU、内存、硬盘型号与参数
    3. 配置清单：1W - 2W元同时满足工作、游戏、生物信息的个人电脑配置（个人使用）

    4. 配置清单：5K - 2W元的高性价比配置（小团队使用）

    5. 配置清单：2W - 50W的主流配置（小团队使用）

    6. 配置清单：15W - 300W的集群配置（大团队使用）

    第二天

    系统安装

    1. 组建 raid 阵列，确保数据安全
    2. 安装 Linux 操作系统
    3. 磁盘分区
    4. 磁盘配额：限制存储、防止爆盘
    5. 网络配置：设置固定IP
    6. 内网穿透：在家也可也访问局域网服务器
    7. 域名解析：使用域名访问服务器
    8. 远程登录

    第三天

    软件安装

    1. 目录结构：公共软件装在哪？公共数据放哪里？
    2. 使用 apt/yum 安装和管理基础软件
    3. 使用 conda 安装和管理常用软件
    4. 如何手动安装软件
    5. Perl：使用 cpanm 管理 Perl 模块
    6. R：Rstudio Server 安装？如何确保 Rstudio 环境与本地统一？
    7. Python：Python 模块的安装和管理
    8. 没有 root 权限如何安装软件？

    第四天

    容器

    1. 理念：开箱即用，免去软件安装的麻烦
    2. docker：docker 的安装和使用
    3. singularity：比 docker 更适合科研计算的容器
    4. 安装：singularity 的安装
    5. 封装：使用 singularity 封装基因组注释流程
    6. 使用：使用 singularity 运行基因课的基因组注释流程

    第五天

    管理

    1. 网络安全：防火墙与端口配置
    2. 用户管理：用户分组、创建和管理
    3. 任务监控：服务器负载监控、网络流量监控和任务查杀

    第六天

    应用

    1. FTP服务：共享科研数据
    2. 云盘：干掉百度云盘
    3. 网站：60分钟学会搭建实验室网站

  • 讲师介绍

    十年以上经验生物信息工程师授课

    基因课介绍

    成立于 2017年7月，专注于生物信息学培训。

    基因课网校：已完成 30多 门视频课程的开发，累计学员 17000余人。

    线下培训班：武汉、成都、西安、杭州、广州、北京等地举办培训班 30多 期。

    主讲老师 张旭东

    曾任华大基因项目组组长、产品研发组组长。
    2014年合伙创办贝纳基因，担任CTO。
    2017年创办基因课，专注生物信息学培训。

    发表文章：麻疯树基因组计划（the plant journal）、鹰嘴豆基因组计划（Nature Biotechnology）、 芝麻基因组计划（Genome Biology）、猕猴桃群体研究（New Phytologist）。

    助教老师 王莹

    曾任华大基因、贝纳基因高级生物信息工程师。

    擅长基因组拼接、比较基因组和进化分析。

    发表文章：甲藻基因组（Science）、穿心莲基因组（The Plant Journal）、野生大豆基因组（Nature Communications）、菊花基因组（Molecular Plant）、鹰嘴豆基因组计划（Nature Biotechnology）、 芝麻基因组计划（Genome Biology）、猕猴桃群体研究（New Phytologist）。

  • 常见问题

    1. 在哪里学习？

    • PC 端：www.genek.cn 点视频课；

    • 微信端："基因课" 公众号点视频课；

    • 有效期内可以无限次回放。

    2. 如何互动答疑？

    • 直播期间：学员可以通过文字提问
    • 直播结束后：通过腾讯会议答疑，学员可以共享屏幕

    3. 我是零基础，能学会吗？

    本课程专为零基础设计，内容相对简单，而且课程周期长，配合互动答疑，只要肯花时间，跟上节奏，一定能学会的。

    4. 电脑配置有什么要求？

    没有特别高的要求，平时使用还比较流畅就行。

    5. 如何报名？

    推荐直接线上购买，如需对公转账，请联系我们。

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    银行对公转账
    户名：武汉简并科技有限公司
    开户银行：汉口银行光谷分行
    账 号：005041000451905

    转账备注“单位-姓名”。

    6. 关于合同、发票、培训通知

    • 通知：可提供培训通知、会议通知
    • 发票：可开培训费、会议费、技术服务费、测序分析费等
    • 合同：可提供合同、发票清单等
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