慢直播:转座子分析
2022年 7月11日 - 7月15日 |21:00 - 22:30 | 线上直播
课程安排
转座子(TE)是基因组的重要组成部分,甚至占据基因组大小的80%以上。本次课程介绍TE注释、
课前预习
赠送课程
第一天
背景知识概要
第二天
软件安装和数据准备
第三~四天
SNP/InDel变异检测原理及实操
第五天
mutmap数据分析
第六天
QTL-seq数据分析
第七天
BSR数据分析及课程总结
售后服务
答疑
[1] Yu S , Young L , H Yaegashi, et al. High performance pipeline for MutMap and QTL-seq. PeerJ, 2022,10:e13170.
[2] Abe A , Kosugi S , Yoshida K , et al. Genome sequencing reveals agronomically important loci in rice using MutMap. Nature Biotechnology, 2012, 30(2):174-178.
[3] Takagi H , Abe A , Yoshida K , et al. QTL‐seq: rapid mapping of quantitative trait loci in rice by whole genome resequencing of DNA from two bulked populations. The Plant Journal, 2013, 74(1).
[4] Zhu H , Zhang M , Sun S , et al. A Single Nucleotide Deletion in an ABC Transporter Gene Leads to a Dwarf Phenotype in Watermelon. Frontiers in Plant Science, 2019, 10.
[5] A single nucleotide polymorphism in an R2R3 MYB transcription factor gene triggers the male sterility in soybean ms6 (Ames1). Theoretical and Applied Genetics, 2021:1-14.
讲师介绍
十年以上经验生物信息工程师授课
基因课介绍
成立于 2017年7月,专注于生物信息学培训。
基因课网校:已完成20余门视频课程的开发,累计学员 20000 余人。
主讲老师 王莹
曾任华大基因、贝纳基因高级生物信息工程师。
擅长基因组拼接、比较基因组和进化分析。
发表文章:甲藻基因组(Science)、穿心莲基因组(The Plant Journal)、野生大豆基因组(Nature Communications)、菊花基因组(Molecular Plant)、鹰嘴豆基因组计划(Nature Biotechnology)、 芝麻基因组计划(Genome Biology)、猕猴桃群体研究(New Phytologist)。
超级会员
可学习基因课线上线下全部课程
¥10900.00
每年
基因课课程全部开放
会员专享免预约腾讯会议答疑
包含:
《基因组与比较基因组专题课程》
《重测序与群体遗传专题课程》
《转录组与表达挖掘专题课程》
《ChIP-Seq数据分析专题课程》
《单细胞转录组分析专题课程》
《生物信息平台搭建专题课程》
《R语言与出版级绘图专题课程》
《叶绿体、线粒体专题课程》
《细菌真菌基因组专题培训班》
《长非编码RNA与表达调控专题》
《 蛋白质组学专题培训》
《代谢组与脂质组学》
《生物信息入门之 Linux》
《生物信息入门之 R》
《生物信息入门之 Python》等
赠送:
全套分析流程、教材
服务器账号供练习
常见问题
1. 如何咨询?
2. 在哪里学习?
PC 端:www.genek.cn 点视频课;
微信端:"基因课" 公众号点视频课;
课程有效期内可以无限次回放。
3. 我是零基础,能学会吗?
1. 学习本次课程必须先掌握测序原理、Linux的简单操作,可以先学习赠送的《15天入门生物信息》课程,一般3到5天可以掌握这些基础;
2. 相比线下培训,线上培训给了学员充足的时间练习,配合答疑,完全可以掌握。
4. 没时间参加直播怎么办?
1. 当天直播结束后10分钟左右,回放会自动生成。
2. 课程期间每天课前或课后都会安排腾讯会议答疑;课程结束后,每周一到周四都会安排腾讯会议答疑。
3. 视频回放结合持续的答疑,可以实现和看直播相当的效果。
5. 电脑配置有什么要求?
平时使用比较流畅就可以,没有特别要求。我们会为大家提供高性能服务器练习使用,大多数据分析都是在服务器完成,个人电脑通过远程访问方式登录服务器。
6. 如何报名?
推荐直接线上购买,如需对公转账,请联系我们。
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银行对公转账
户名:武汉简并科技有限公司
开户银行:汉口银行股份有限公司光谷分行
账 号:005041000451905
开户行行号:313521000982
转账备注“单位-姓名”。
7. 关于合同、发票、培训通知