慢直播：R语言与生物信息出版级绘图

1. R 语言介绍

2. R 语言绘图体系介绍

3. 出版级绘图介绍

4. 环境部署：R 安装、Rstudio 安装、R 包安装

1. 数据结构：向量、数据框、因子、列表

2. 数据类型：数值型、字符型、逻辑型、日期型

3. 数据属性：连续型、有序型、分类型

1. 使用 Tidyverse 进行数据整理

2. R 中的管道

3. 使用 facats 包处理因子

1. 快速入门：画一张散点图 

2. 深入理解：映射和标度

3. 深入理解：几何对象与统计变换

4. 深入理解：坐标系

5. 深入理解：主题

1. 离散型变量的颜色搭配

2. 连续型变量的颜色搭配

3. 不同期刊风格的颜色搭配

1. 条形图

2. 对条形图进行排序

3. 对条形图进行分组排序

2. 翻转坐标系条形图

3.棒棒糖图

1. 饼图与极坐标系

2. 更美的饼图

3. 甜甜圈图

4. 玫瑰图

1. 并排柱状图

2. 堆叠柱状图

3. 填充柱状图

4. 添加数字、百分比等信息

1. 散点图

2. 气泡图

3. 添加拟合曲线

4. 添加相关系数和 Pvalue

5. 生物信息案例：更美的火山图

6. 生物信息案例：更美的 PCA 二维图

1. 直方图

2. 密度图

3. 峰峦图

1. 箱线图

2. 小提琴图

3. 蜂窝图

4. 云雨图

5. 添加统计检验

1. 维恩图

2. UpSet 图

1. 相关系数热图

2. 案例：重新绘制 WGCNA 中模块与表型相关性

1. 使用 Pheatmap 绘制简单热图

2. 使用 ComplexHeatmap 绘制复杂热图

1. 用于展示染色体结构、基因分布等信息

2. 常出现在基因组文章中

1. 用于展示不同物种中同源基因或者一个基因家族中基因之间的序列差异

2. 常用于基因家族分析中

1. 用于展示序列特征

2. 常用于基因家族分析、Chip-Seq 分析中

1. 使用 cowplot 包进行拼图

2. 使用 patchwork 包进行拼图

3. 一页多图的布局

4. 图中图

5. 局部放大