• 课程简介

    互动直播 + 腾讯会议答疑 + 无限次回看

    学习方式

    • 在线直播
    • 每天晚上 2小时，连续 10天
    • 无限次回看视频
    • 通过微信群、腾讯会议终生答疑

    配套资料

    • 自编配套教材
    • 一整套分析代码和测试数据
    • 预装了所有软件的 Linux 服务器
    • 赠送18天的普通转录组直播课程
    • 赠送 Linux、Perl、Python 、ggplot 、转录组等10门生物信息基础课程

  • 课程安排

    本次课程将讲解small RNA数据分析的原理和实操，适合动植物研究方向的科研人员参加。

    课前预习

    提前预习录播的基础课程

    1. illumina 测序原理
    2. 生物信息入门之 Linux（2020版）
    3. 转录组原理篇

    第一天

    small RNA方法原理

    1. RNA的分类
    2. small RNA 建库原理
    3. small RNA 分析流程
    4. small RNA文献讲解

    第二天

    small RNA参考数据准备

    1. 参考基因组准备
    2. 编码基因gtf/gff文件
    3. 重复序列gff
    4. Rfam 数据库
    5. miRNA数据库

    第三天

    small RNA 过滤及比对

    1. small RNA测序数据质控过滤
    2. 参考基因组比对
    3. 过滤后数据统计及绘图

    第四天

    small RNA 分类鉴定-上

    1. 比对Rfam 鉴定ncRNA 分类
    2. 鉴定来自编码基因的small RNA
    3. 鉴定来自repeat区的small RNA

    第五天

    small RNA 分类鉴定-下

    1. 鉴定已知miRNA
    2. small RNA 鉴定结果排序
    3. small RNA 分类统计及绘图

    第六天

    novel miRNA 预测

    1. novel miRNA预测原理方法
    2. 动物 novel miRNA预测实操
    3. 植物 novel miRNA 预测实操

    第七天

    miRNA 序列分析

    1. miRNA 首位位碱基的偏好性分析
    2. miRNA 各位置碱基的偏好性分析
    3. miRNA 二级结构绘图
    4. miRNA 家族统计

    第八天

    miRNA的表达分析

    1. miRNA 表达定量
    2. miRNA 相关性分析及热图绘制
    3. miRNA 差异表达分析

    第九天

    miRNA 靶基因分析-上

    1. 靶基因预测原理方法
    2. miRNA靶基因数据库介绍
    3. 动物miRNA靶基因预测

    第十天

    miRNA 靶基因分析-下

    1. 植物miRNA靶基因预测
    2. 多种方法预测结果整合
    3. 差异表达miRNA靶基因的富集分析

  • 讲师介绍

    十年以上经验生物信息工程师授课

    基因课介绍

    成立于 2017年7月，专注于生物信息学培训。

    基因课网校：已完成 30多 门视频课程的开发，累计学员 8000 余人。

    线下培训班：武汉、成都、西安、杭州、广州、北京等地举办培训班 30多 期。

    主讲老师 王莹

    曾任华大基因、贝纳基因高级生物信息工程师。

    擅长基因组拼接、比较基因组和进化分析。

    发表文章：甲藻基因组（Science）、穿心莲基因组（The Plant Journal）、野生大豆基因组（Nature Communications）、菊花基因组（Molecular Plant）、鹰嘴豆基因组计划（Nature Biotechnology）、 芝麻基因组计划（Genome Biology）、猕猴桃群体研究（New Phytologist）。

    助教老师 张旭东

    曾任华大基因项目组组长、产品研发组组长。
    2014年合伙创办贝纳基因，担任CTO。
    2017年创办基因课，专注生物信息学培训。

    发表文章：麻疯树基因组计划（the plant journal）、鹰嘴豆基因组计划（Nature Biotechnology）、 芝麻基因组计划（Genome Biology）、猕猴桃群体研究（New Phytologist）。

  • 常见问题

    1. 在哪里学习？

    • PC 端：www.genek.cn 点视频课；

    • 微信端："基因课" 公众号点视频课；

    • 有效期内可以无限次回放。

    2. 如何互动答疑？

    • 直播期间：学员可以通过文字提问
    • 直播结束后：每晚 19:30 - 20:00 腾讯会议答疑，学员可以共享屏幕

    3. 我是零基础，能学会吗？

    能。我们会赠送零基础入门课程，并提供每晚腾讯会议答疑。

    4. 电脑配置有什么要求？

    没有特别高的要求，平时使用还比较流畅就行。我们会为大家提供高性能服务器，大多数据分析都是在服务器完成，个人电脑通过远程访问方式登录服务器。

    5. 如何报名？

    推荐直接线上购买，如需对公转账，请联系我们。

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    银行对公转账
    户名：武汉简并科技有限公司
    开户银行：汉口银行光谷分行
    账 号：005041000451905

    转账备注“单位-姓名”。

    6. 关于合同、发票、培训通知

    • 通知：可提供培训通知、会议通知
    • 发票：可开培训费、会议费、技术服务费、测序分析费等
    • 合同：可提供合同、发票清单等
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